Ως αρχηγός του ΓΕΣ εμφανιζόταν να έχει εκπονήσει επιχειρησιακό σχέδιο για τη σταθεροποίηση της Αθήνας
Ο στρατηγός Φραγκούλης Φράγκος έκανε δυναμική επανεμφάνιση με το θέμα της Μακεδονίας και της ονομασίας των Σκοπίων ως κεντρικός ομιλητής στο συλλαλητήριο και πλέον εμπλέκεται σε πολλά σενάρια για νέο πολιτικό κόμμα.
Ο στρατηγός ξεχώριζε στις απόρρητες συσκέψεις που γίνονταν πίσω από τις πόρτες του Υπουργείου Εθνικής Άμυνας, ενώ έχει απασχολήσει τη δημοσιότητα με τις ασκήσεις που είχε κάνει στον στρατό.
Ήταν αρχηγός ΓΕΣ μεταξύ Αυγούστου 2009 και Νοεμβρίου 2011 και μετέπειτα υπουργός Εθνικής Άμυνας στην κυβέρνηση του κ. Π. Πικραμμένου (17 Μαΐου - 21 Ιουνίου 2012).
Δημοσιεύματα της εποχής προς το τέλος της στρατιωτικής του καριέρας τον αναφέρουν ως τον εμπνευστή της Τάφρου στον Εβρο, ενώ ο ίδιος φέρεται να έλεγε στις απόρρητες συσκέψεις ότι έχει σχέδιο για όλα.
Αυτό που είχε προκαλέσει ιδιαίτερη αίσθηση ήταν τα δημοσιεύματα που τον ήθελαν ως αρχηγός του ΓΕΣ να είχε εκπονήσει επιχειρησιακό σχέδιο για τη σταθεροποίηση της Αθήνας σε διάφορες ακραίες περιπτώσεις.
Μάλιστα ο τότε υπουργός Εθνικής Άμυνας Πάνος Μπεγλίτης φέρεται παρακολουθούσε στενά τις απόψεις αλλά και τις παρασκηνιακές κινήσεις του πανίσχυρου στρατηγού ο οποίος είχε μεγάλη δύναμη στον Στρατό Ξηράς.
Ένα από αυτά τα σχέδια φέρεται πως ήταν εκτελέστηκε χωρίς να ενημερωθεί η πολιτική ηγεσία. Το σχέδιο φέρεται να εκτελέστηκε στις 4 Φεβρουαρίου του 2011 στο Κιλκίς με την ονομασία «Καλλίμαχος», ένα σχέδιο για το οποίο η πολιτική ηγεσία δεν ενημερώθηκε και δημιουργήθηκε θερμό επεισόδιο στο γραφείο του τότε υπουργού.
Ήταν η νατοϊκή άσκηση καταστολής πλήθους που έλαβε χώρα στις 4 Φεβρουαρίου 2011 στο στρατόπεδο «Κορομηλά» στην Αργυρούπολη του Δήμου Κιλκίς με την ονομασία «Καλλίμαχος».
Όπως έγραφε τότε το Βήμα της Κυριακής ο κ. Μπεγλίτης ομολόγησε στη Βουλή στις 10 Φεβρουαρίου 2011 ότι ο ίδιος και ο κ. Βενιζέλος έμαθαν για την άσκηση από τον «Ριζοσπάστη». Μετά την άσκηση σημειώθηκε «θερμό επεισόδιο» με πρωταγωνιστές την ηγεσία του υπουργείου Αμυνας και τον αρχηγό ΓΕΣ στο γραφείο του κ. Βενιζέλου στο Πεντάγωνο. Η αιτία ήταν ότι ο κ. Φράγκος υπεραμύνθηκε της άποψης ότι δεν όφειλε να ενημερώσει.
Η ίδια η άσκηση «Καλλίμαχος» είχε στρατιώτες ντυμένους διαδηλωτές που κρατούσαν σημαίες και φώναζαν ρυθμικά «πίσω-πίσω» σε άλλους στρατιώτες που ήταν παραταγμένοι όπως παρατάσσονται τα ΜΑΤ και στο τέλος συγκρούστηκαν όπως συγκρούονται οι διαδηλωτές με τα ΜΑΤ. Δεν έλειψαν και μερικοί στρατιώτες που συνόδευαν εκπαιδευμένα λυκόσκυλα. Σε άλλο σκέλος της άσκησης ένα φορτωτικό μηχάνημα έτρεχε για να παραμερίσει δύο πυρπολημένα αυτοκίνητα που ήταν τοποθετημένα κάθετα σε έναν δρόμο. Επρόκειτο για εκπαίδευση στρατιωτών σε τακτικές αστυνομικών των ΜΑΤ για να αποκαταστήσουν την τάξη σε μια πόλη σε κατάσταση χάους.
