Ως μια από τις έξι καλύτερες πρακτικές διαχείρισης προστατευόμενων περιοχών σε πανευρωπαϊκό επίπεδο αναγνωρίστηκε η συνεργασία των τοπικών φορέων της Πρέσπας, μέσω της Επιτροπής Διαχείρισης Υγροτόπου, η οποία διακρίθηκε στη φετινή, πρώτη, απονομή των βραβείων Natura 2000.
Στην Επιτροπή Διαχείρισης Υγροτόπου της Πρέσπας, η οποία λειτουργεί ως συμβουλευτικό όργανο του Φορέα Διαχείρισης του Εθνικού Πάρκου της περιοχής, συμμετέχουν όλοι οι τοπικοί φορείς. Η διάκριση αφορούσε στον τομέα «Συμφιλίωση συμφερόντων και αντιλήψεων».