Οι δύο ελληνικές ομάδες μπορούν να συναντηθούν μόνο στον τελικό της διοργάνωσης
Βατή ήταν η κλήρωση για τις δύο ελληνικές ομάδες που συμμετέχουν τους «8» του Conference League, δεδομένων των άλλων ομάδων που ήταν πιθανοί αντίπαλοι, ενώ Ολυμπιακός και ΠΑΟΚ μπορούν να βρεθούν ως αντίπαλοι μόνο στον τελικό της 29ης Μαΐου στην OPAP Arena στη Νέα Φιλαδέλφεια.
Συγκεκριμένα, ο Ολυμπιακός θα αντιμετωπίσει την τουρκική Φενέρμπαχτσε με τον πρώτο αγώνα να γίνεται στις 11 Απριλίου στο "Καραϊσκάκης" και η ρεβάνς στις 18 Απριλίου στην Κωνσταντινούπολη. Ο ΠΑΟΚ θα αντιμετωπίσει στις 11 Απριλίου την βελγική Μπριζ εκτός έδρας και στις 18 Απριλίου στην Τούμπα.
Τα άλλα δύο ζευγάρια είναι Αστον Βίλα-Λιλ, τον νικητή του οποίου θα αντιμετωπίσει στον ημιτελικό, αν προκριθεί, ο Ολυμπιακός και Βικτόρια Πλζεν - Φιορεντίνα τον νικητή ρου οποίου θα αντιμετωπίσει στον ημιλελικό, αν προκριθεί, ο ΠΑΟΚ.