Η σχέση του Γιάννη Αναστασίου με τη διοίκηση του Παναθηναϊκού όλα αυτά τα χρόνια που ο Έλληνας κόοουτς βρίσκεται στο τιμόνι της ομάδας είναι άριστη. Υπάρχει αλληλοσεβασμός και ταύτιση απόψεων σε όλους τους τομείς, από το πλάνο που πρέπει να ακολουθήσει ο σύλλογος μέχρι και τις μεταγραφές που πρέπει να γίνουν.
Τελευταία, ωστόσο, παρατηρείται μια "διαφωνία" για μία συγκεκριμένη περίπτωση ποδοσφαιριστή, με τις δύο πλευρές πάντως να έχουν τα δικά τους επιχειρήματα για την υπόθεση.
